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프로젝트 설명

BioJava aims to provide a comprehensive set of Java components for the rapid development of applications in Bioinformatics. It contains interfaces for representing Sequences, Features, and other important bioinformatics concepts. It can also read and write sequence data in a variety of common formats and communicate with Ensembl databases and with DAS and BioCorba servers.

System Requirements

System requirement is not defined
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2002-03-15 16:35
1.21

이 릴리스에는 일반 BioSQL 시퀀스는 데이터베이스의 목적은 시퀀스 데이터 스토리지 (읽기 및 쓰기)을 포함 실종 Blast2Html 데모를 추가, 그리고 다양한 문서 수정이 포함되어있습니다.
Tags: Minor feature enhancements
This release includes general-purpose sequence data storage in BioSQL sequence databases (read and write), adds the missing Blast2Html demo, and includes various documentation fixes.

2002-02-13 17:41
1.20

BioJava 1.2 Blast 출력 및 시퀀스 파일 포맷에 대한 파서 상당한 향상이 포함되어있습니다. 또한 자바 바이트 코드에 숨겨진 마르코프 모델 컴파 일할 수있는 향상된 동적 프로그래밍 패키지, 그리고 지원의 해설 시스템 1.00 분산.
Tags: Major feature enhancements
BioJava 1.2 includes considerable enhancements to the parsers for
Blast output and sequence file formats. There's also an improved
dynamic programming package, which can compile Hidden Markov Models to
Java bytecode, and support for the Distributed Annotation System 1.00.

2001-02-16 21:48
1.10

시퀀스 데이터의 폭발과 FASTA 출력, 생물학 시퀀스의 조립을위한 지원, 변경 알림 및 거부권을위한 보급 이벤트 모델에 대한 파서를위한 플러그 I / O를 프레임 워크.
Tags: Major feature enhancements
Pluggable I/O framework for sequence data, parsers for Blast and FASTA output, support for assembly of biological sequences, and a pervasive event model for change notification and veto.

2001-01-30 15:12
1.01

일부 버그 javac 1.3와 제이빌더와 컴파일을 고정했다. FASTA 파일에 더 이상 설명이 라인에 대한 지원이 추가되었습니다. SimpleDistributions 이제 제대로 훈련을하실 수있습니다.
Some bugs were fixed with compiling with javac 1.3 and JBuilder. Support for longer description lines in FASTA files was added. SimpleDistributions can now be trained properly.

2001-01-30 15:12
1.0

초판.
Initial release.

Project Resources

Project Page 다운로드: changelog 다운로드: CVS Home Page 다운로드: List 다운로드: TGZ