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xeo は Java を用いたナノ構造のための無料 (GPLv3) 開いているプロジェクト管理です。

刺身プロジェクト ホスト トランス プロテオーム パイプライン (TPP)、基づく量産仕様 (MS、MS/MS) のためのツールの成熟したスイート プロテオミクス: 統計的検証、定量、視覚化、および私たちのオープン mzXML 形式に raw の MS データからコンバーター。

オープン ソースは C. 実装のプロパティ ルーチン国際協会からの IAPWS IF97 蒸気表プロパティの水および蒸気の蒸気します。双方向プロパティを解決し、テストが含まれていますスイート。C または C++、Fortran、Python、LabVIEW、オクターブ、アセンドから使用できます。

JChemPaint アプレットと Swing アプリケーションはほとんどの化学教科書で見つけられるそれらのような二次元化学構造を描画するための Java プログラムです。それは化学開発のキット (cdk.sf.net) に基づいています。Http://jchempaint.github.com ダウンロード、追跡、およびソース コード リポジトリで掲載することができます。

完全スペクトル Hamaker 係数 （ヴァン der Waals の相互作用のロンドンの分散の任期） を計算するためのクロスプラット フォーム、Java/C アプリ http://geckoproj.sourceforge.net/=> リフシッツ理論プロジェクトのウェブサイトを使用します。

Cca フォーラム一般的なコンポーネント アーキテクチャ ツールやチュートリアルを統一します。HPC、および関連ツールの CCA 仕様、Ccaffeine フレームワークが含まれています。これらは多言語科学並列計算をサポートします。

RMG は分子の反応の一般的な理解を使用して化学反応ステップから成る運動モデルを構築する自動化学反応機構ジェネレーター （現在に限る C、H、O、および S 原子です。

MOPAC7 はジェームス j. p. スチュワートと同僚によって書かれた半経験的量子力学のコードです。このプロジェクトの目的は MOPAC7 の機能を他のプログラムを提供するライブラリと同様に、スタンドアロンのプログラムとして MOPAC7 を維持することです。

ロースは C++ で書かれた分子シミュレーション データを分析するための新しいツールを作成するための軽量オブジェクト指向ソフトウェア ライブラリです。主な設計目標は、簡単にメソッドを実装する新しい分析のカジュアルなプログラマーを許可します。

XDrawChem は描画と化学構造との反応を分析するために設計図面アプリケーションです。

モーフィアスは、高解像度タンデム質量スペクトルのために地面から設計された質量 spectrometry–based プロテオミクス データベース検索アルゴリズムです。我々 は、高解像度 MS/ms、単純なスペクトル前処理と得点はもともと Sequest、マスコット、OMSSA など、低解像度 MS/MS の開発よりより複雑なアルゴリズムを実行することを発見しました。モーフィアスも非常に高速です-人間の大量のデータセットに対して OMSSA のほぼ 5 倍まで。C# で記述され、MIT の寛容なライセンスの下で利用できるオープン ソース。

Motofit は共同 Abeles 行列を用いた中性子および x 線反射率データをリファイン Parratt 再帰と最小二乗フィッティング (遺伝的アルゴリズムまたはレーベンバーグ)/。IGOR Pro 環境 (TM Wavemetrics） で動作します。